根据你的描述，你收到了日本无犯罪证明的补件请求信，并且IRCC给了你60天的期限。如果你已经完成了补件，你可以考虑先上传申请书，同时说明你已经联系了办事处，并且他们表示需要2-3个月的时间来完成。这样做可以让IRCC了解你已经采取了行动，并且可以尽快处理你的申请。如果在一个月之后，你还没收到IRCC的回复或者申请被拒绝，你可以考虑通过webform再次联系IRCC，并询问是否可以延长期限，并解释你已经采取了行动，但办理时间超出了60天。另外，你还可以考虑咨询移民律师或与IRCC的客服直接沟通，以获取更准确的建议。祝你顺利！
