根据您提供的情况，在EE profile上可以将这段工作经历视为一段连续的工作经历。您可以将起始日期设置为2021年1月，结束日期设置为2022年9月。在工作描述中，您可以说明从2022年6月底到2022年9月期间休假了三个月，并在十月份回来后获得了升职。这样，您只需提供一份雇佣函来证明您的整个工作经历，不需要两份雇佣函。关于升职部分，您可以在工作描述中详细说明您升职后的新职位和责任。
请确保提供的雇佣函包括公司名称、您的职位、工作起止日期和您的职责说明。此外，雇佣函应包含公司的信头或标志，并由雇主签名和日期确认。
尽量提供尽可能详细的工作描述和任职期间的职责，这样移民官员在审查您的申请时能够更清楚地了解您的工作经历。
如果您对在EE profile上如何填写工作经历仍然感到不确定，建议您咨询专业移民顾问或律师，以确保您的申请符合标准并能够获得最佳结果。