持有台湾护照的旅客在乘飞机在加拿大转机时需要申请电子旅行授权（Electronic Travel Authorization，简称eTA）。eTA是一种电子许可证，用于方便入境加拿大的旅客。根据加拿大政府的规定，除非是加拿大公民、美国公民或拥有加拿大永久居民身份，否则来自所有签证豁免国家（包括台湾）的旅客都需要申请eTA。所以，如果你持有台湾护照并且计划乘飞机在加拿大转机，你需要提前在抵达加拿大之前申请eTA。申请eTA可以通过加拿大政府的官方网站进行，填写申请表格并支付相应的费用。一旦你的eTA申请被批准，你就可以在指定期限内使用它进行多次飞行的加拿大转机了。在申请eTA之前，确保你的护照有效期足够长、个人资料准确无误，并且了解适用的申请费用和要求。