根据您提供的信息，小签（学习签证）上写的过期日期是9月30日。如果您的毕业工签申请在境内提交并且您已离开加拿大，您可以使用学习签证在九月份入境。根据加拿大移民、难民和公民部（IRCC）的规定，小签（学习签证）的过期日期是指在此日期之前您可以合法留在加拿大而不需要延期或重新申请签证。因此，如果您计划在九月底入境，小签的过期日期应该是合法的。
然而，请根据您的具体情况与相关机构（如加拿大驻中国大使馆或领事馆）联系以获得最新的、准确的信息和建议。他们将能够为您提供与您特定情况相符的指导，以确保您的入境和签证手续顺利进行。希望您顺利完成毕业工签申请，并能够顺利返回加拿大继续您的学习和工作。
