如果您在答卷中回答说您在加拿大境内申请配偶工签，但实际上您上传的文件是关于境外申请的，这可能会引起一些问题。在申请配偶工签时，正确和一致的申请材料是非常重要的。如果上传的文件与申请人在问卷中提供的信息不符，这可能导致申请被拒绝或有延误。因此，为了避免不必要的问题和延误，建议您重新检查并上传正确的申请材料。
在您的情况下，如果您打算在加拿大境内申请配偶工签，最好提供与该申请相对应的文件，以证明您是在加拿大境内递交申请的。如果您意外上传了境外申请的文件，您可以尝试联系签证申请中心或加拿大边境服务署（CBSA）以解决这个问题。他们可能会要求您提供正确的文件，以确保您的申请得以处理。
总之，提交准确和一致的申请材料对于获得配偶工签非常重要。如果您注意到了您提交的错误文件，请尽快与相关部门联系并提供正确的材料，以确保您的申请顺利进行。