关于MyCIC上补料处的显示问题，有几点建议可以参考。
首先，对于主申和配偶的Schedule A，如果补料的地方只显示在主申这里，并且没有明确注明哪一条上传的是哪一个人的，可以将两份表格分别命名为主申的Schedule A和配偶的Schedule A，以便系统能够区分。
其次，如果系统要求主申补料的无犯罪证明，但是出现了两个上传处且截止时间不一样，可以尝试联系CIC官方或提交一个Webform来询问具体该如何辨别。可能是系统错误导致了这种情况，但最好还是得到官方的确认和指导。
最后，关于截止时间的问题，如果已经上传了相关文件但没有提交按钮，系统一旦到达截止时间，并不会自动提交已上传的文件。你可以放心地等待完成其他表格，并在所有准备好的文件都上传后点击提交按钮。只有在提交按钮点击后，所有表格才会同时提交。
如果以上建议仍然没有解决你的问题，建议尝试联系CIC官方或等待他们对你的Webform进行回复。祝你顺利解决问题，感谢您的提问！