根据我所了解的情况，如果您的配偶的护照在申请时报备了，并且不久后即将过期，这可能会对您的申请产生一定影响。加拿大移民局通常会要求申请人提供有效期至少还有一年的护照。如果配偶的护照即将过期，您可能需要尽快办理新的护照，并将新的护照信息及时更新给移民局。这样可以确保您的配偶的护照在申请阶段和审批过程中都是有效的。
至于FSW申请的等待时间，如果申请持续两年，申请人的护照在这期间内不一定需要一直保持有效。然而，如果护照过期并且您需要继续留在加拿大等待申请结果，那么您可能需要延长或更新您的临时居住许可或签证。在这种情况下，您可能需要联系加拿大境内的移民局或批准机构，咨询有关临时身份更新的事宜。
总之，保持有效的护照和及时更新护照信息对于您的申请是很重要的。如果您有任何关于护照过期或申请延迟的担忧，建议您咨询专业的移民律师或咨询机构，以获取准确和可靠的建议。祝您的申请顺利！