根据您的描述，您在2020年拿到了加拿大的工签，但由于疫情原因，您尚未办理护照小签。对于EE（Express Entry）移民申请，没有有效的护照小签可能会影响您的申请。
根据加拿大移民规定，申请人需要提供有效的身份文件来证明其合法居留。这包括护照及签证等文件。如果您的护照上没有有效的签证，移民局可能会拒绝您的申请。
然而，由于疫情的特殊情况，加拿大移民局可能对延迟办理护照小签有所宽容。您可以尽快联系加拿大移民局或专业移民律师，并说明您的情况。他们可以为您提供相关建议和帮助，以确保您的EE移民申请能够顺利进行。
总之，延迟办理护照小签可能会对您的PR（永久居民）EE申请产生影响。务必尽快与移民局或专业律师联系，以获得更详细的指导和帮助。