针对境内团聚移民申请中配偶有境外犯罪记录的情况，CIC（加拿大移民、公民和难民事务部）通常会对此进行特别审查。根据加拿大的移民法规定，具有一定严重性的犯罪记录可能会对移民申请产生不利影响。
当CIC发出询问邮件询问有关问题时，您应该如实回答，并提供相关的证明材料以支持您的回答。与此同时，您可以附上一封解释信，详细说明配偶过去犯罪记录的情况，提供额外的证据来证明配偶已经改过自新，对社会做出了积极贡献。
然而，无法一概而论移民申请是否会因为配偶的犯罪记录而被拒绝。每个案件都会根据具体情况和个人的背景进行综合评估。关键因素包括犯罪的性质、严重程度、个人表现以及过去行为对加拿大公共安全的潜在影响等等。如果能够证明配偶的犯罪记录不会对加拿大的利益和安全构成威胁，并提供充足的证据支持，移民申请仍有可能获得批准。
建议您寻求专业的移民顾问或律师的帮助，他们可以根据您的具体情况提供个性化的建议，并帮助您处理与CIC的沟通和申请过程。