据我所知，提交EE申请后材料消失的情况相对较少，但也不是完全没有发生过。如果你的上传文件在提交后消失了，我建议你采取以下措施：
1. 刷新页面和清除浏览器缓存：有时候页面加载不完全或页面显示异常可能是由于浏览器缓存问题引起的。尝试清除缓存和刷新页面，看看文件是否能够正常显示。
2. 检查文件格式和大小：确保你上传的文件符合要求，如文件格式、大小等。如果文件不符合要求，系统可能会自动删除或不予显示。
3. 重新上传文件：如果你确定文件没有问题，可以尝试重新上传文件。确保按照系统要求的方式上传文件，可以避免出现错误。
4. 联系CIC（加拿大移民局）：如果以上方法都无法解决问题，你可以联系CIC寻求帮助。他们可能会检查系统问题或者提供其他解决方案。
虽然这些步骤可能会帮助你找回消失的文件，但是请记得及时跟进和解决这个问题，以确保你的申请能够正常进行。祝你好运！