根据您描述的情况，EE-BCPNP的语言成绩在审理期间过期，可能会对申请产生一定的影响。通常情况下，移民部门要求申请人在提交申请时，提供有效的语言成绩单。如果在审理期间语言成绩过期，移民部门可能会视其为不符合要求，导致PNP部分的审理被拒绝。
然而，具体处理方式可能会因个案而异，最好的解决方案是联系移民部门或您的代理中介，向他们详细说明情况并询问他们对此的看法。他们会提供具体的指导和建议，帮助您解决这个问题。
关于递交时间和补交新的语言成绩的问题，我没有找到明确的官方政策。可能的做法是根据递交PNP的时间为准，然后在后续递交EE的部分时，补交一份新的有效语言成绩。但这只是个人理解，最好咨询专业人士以获得准确信息和指导。
至于审理时间较长的情况，我无法给出具体案例。处理时间的长短可能受到许多因素的影响，如申请的复杂性、材料的准备时间以及移民部门的工作负载等。您可以继续通过邮件咨询移民部门以获取更多关于您案件审理进度的信息。