根据您提供的信息，您在EE profile中将ECA报告号码填写成了WES参考号码，并且通过双学位获得了ITA。由于填写错误，我建议您立即联系加拿大移民部门，说明情况并提供正确的ECA报告号码。您可以请求他们提供允许您附上一封解释信的机会。在解释信中，您可以详细解释您填写错误的原因，并附上正确的ECA报告号码以作补充。同时，附上其他必需的文件和材料以支持您的申请。虽然无法确保会被接受，但提供解释和正确的信息将增加您被接受的机会。
请注意，每个案件的具体情况可能不同，这只是一些建议。最好的做法是尽快与加拿大移民部门或官方渠道联系，咨询具体的情况并寻求他们的指导。他们将能够为您提供最准确和适用的建议。