加拿大公民护照与永久居民护照在身份和权利方面有明显的区别。
首先，加拿大公民护照是作为加拿大公民的身份证明，只有获得加拿大公民身份的人才有资格申请并持有。持有加拿大公民护照可以享受加拿大国内外的诸多权益和待遇，比如投票权、参与政府福利计划等。
与之相对的，永久居民护照是给予在加拿大获得永久居民身份的人使用的。永久居民护照是作为身份证明和旅行文件，持有者可以在加拿大国内自由居住和工作，但在某些方面与公民护照持有者有所不同，比如不能投票，不能担任某些政府职位等。
其次，申请和获得加拿大公民护照与永久居民护照的程序和条件也有区别。获得永久居民身份后，通常需要居住和工作一定的时间才有资格申请成为加拿大公民。公民身份的申请程序较为复杂，包括语言要求、居住要求、公民考试等。
总之，加拿大公民护照和永久居民护照在身份和权益方面有明显的区别。公民护照是加拿大公民的身份证明和旅行文件，享受更多的权益和待遇；永久居民护照是给予在加拿大获得永久居民身份的人使用，适用于居住和工作，但在某些方面有所限制。