对于配偶团聚申请，通常来说，申请人是可以选择加拿大的任意城市的。在配偶团聚申请中，配偶通常是加拿大公民、永久居民或持有有效工作许可的人。当配偶团聚申请被批准后，移民局会发放配偶移民签证。一旦获得签证，配偶可以在加拿大的任何地方居住和工作。
然而，需要注意的是，申请人和配偶必须提供合理的解释和证据，以证明他们已经计划好了在加拿大的定居安排，包括住房、就业机会、社交网络等。移民局希望确保申请人有稳定的生活和经济支持，并能够成功融入加拿大社会。
此外，如果配偶正在加拿大定居并工作或学习，配偶团聚申请的处理时间通常会比较短。如果配偶已经在加拿大的某个城市居住和有稳定的生活条件，那么选择该城市作为申请的目标城市是比较合理的。
综上所述，配偶团聚申请一般来说是可以选择加拿大的任意城市的，但需要提供合理的定居安排证明。