边境检查站在高峰时段面对流量增加时，可以采取一些措施来有效处理：
1. 增加人手和设备：增派更多人员和检查设备来加速通关流程。
2. 制定分时段通行政策：对高峰时段实施分时段通行政策，如增加早晚高峰的工作人员，以分流流量。
3. 提前预警和安排：提前预测高峰时段，提醒游客避开拥堵时段或提前安排行程。
4. 加强协调与合作：加强与其他边境检查站和相关部门的合作协调，共同处理流量高峰。
5. 利用科技手段：引入智能科技应用，如自助通关系统、电子护照等，提高通关效率。
这些措施可以帮助边境检查站更好地处理高峰时段的流量增加，提升通关效率，为游客和居民提供更好的服务。
