根据您描述的情况，如果您以part-time的身份工作超过了合同所规定的工作时长，这可能会对您的EE申请产生一定的影响。
在加拿大，移民局对技术移民申请者进行评分时，会考虑申请者的工作经验和工作时长。如果您在EE申请中标记自己是full-time工作，但在事实上您的合同状态是part-time，录入了超过合同约定的40小时工作时长，这可能会导致EE对您的评分产生负面影响。
在EE的视角来看，您的全职起始时间应该是您开始录入40小时工作时长的那一周。这一点是根据您实际工作的时长和EE的认可标准来决定的，签署全职合同的生效日期并非唯一决定因素。
建议您在进行EE申请时，确保在申请中提供准确的工作信息，包括实际工作时长和合同状态。如果您的合同状态有所变化，可以考虑在申请中解释清楚并提供相关证明文件。此外，您还可以咨询专业的移民律师或顾问以获取更准确的建议和指导。请注意，我并非移民专家，建议您在做出决策前进一步咨询相关专业人士。